Sau thời gian xây dựng Hệ thống miễn thuế, giảm thuế, hoàn thuế, không thu thuế và xử lý tiền nộp thuế thừa điện tử theo phê duyệt của Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan tại Quyết định số 3535/QĐ-TCHQ ngày 27/11/2018 và chuẩn bị triển khai thực hiện, Tổng cục Hải quan thông báo đến các cục hải quan tỉnh, thành phố để chính thức triển khai trên phạm vi toàn quốc việc xử lý miễn thuế, giảm thuế, hoàn thuế, không thu thuế và xử lý tiền thuế nộp thừa trên Hệ thống điện tử (viết tắt là Hệ thống MGH) kể từ ngày 23/11/2020 (riêng phân hệ xử lý miễn thuế hàng hóa nhập khẩu phục vụ trực tiếp an ninh, quốc phòng, Tổng cục Hải quan sẽ có thông báo triển khai sau).
Mọi vướng mắc phát sinh vượt thẩm quyền trong quá trình triển khai Hệ thống MGH thì kịp thời báo cáo, liên hệ với Tổ triển khai Hệ thống MGH theo Quyết định số 3204/QĐ-TCHQ hoặc Tổ hỗ trợ triển khai Hệ thống MGH theo Quyết định số 3205/QĐ-TCHQ ngày 18/11/2020 của Tổng cục Hải quan để được hỗ trợ, phối hợp xử lý.